Insomnie : la clé se cache dans l’intestin

Les micro-organismes intestinaux pourraient influencer la qualité du sommeil. Un récent étude menée en Chine démontre que les habitudes de sommeil et la composition du microbiome intestinal sont étroitement liées, davantage qu’on ne le pensait.

Ces découvertes ouvrent de nouvelles voies de recherche sur l’insomnie, un trouble qui touche entre 10 et 20% des adultes à l’échelle mondiale, selon des spécialistes du Hospital de Clínicas de l’Université de Buenos Aires (UBA).

La relation entre l’intestin et le cerveau est devenue un point central de la recherche scientifique. Nous savons désormais que le microbiome intestinal influe sur plusieurs fonctions physiologiques et mentales, dont la qualité du sommeil.

D’après la clinique spécialisée en gastro-entérologie, Dr. Jesica Andruetto (MN 146.855) du Hospital de Clínicas, « ces dernières années, les recherches en neurosciences et microbiologie ont révélé la communication étroite entre l’intestin et le cerveau, ce qu’on appelle l’axe intestin-cerveau ».

Ce groupe de micro-organismes régule la production de métabolites, participe à la modulation du système immunitaire, et communique directement avec le système nerveux central. Ces mécanismes lient le microbiote intestinal non seulement à l’insomnie, mais également à des états dépressifs et des troubles du comportement.

La publication scientifique dirigée par le Dr. Shi Shangyun au Hôpital Cérébral Affiliated to Nanjing Medical University a étudié pour la première fois si le lien entre le microbiome et l’insomnie est causal et non seulement statistique.

L’étude a inclus des analyses génétiques de plus de 387 000 personnes souffrant d’insomnie et des données de microbiome de 26 500 volontaires européens. Les chercheurs ont utilisé une analyse de randomisation mendélienne pour découvrir des relations de cause à effet entre des gènes liés à l’insomnie et la présence de bactéries intestinales.

Les résultats ont permis d’identifier 41 types de bactéries intestinales pouvant influencer l’insomnie dans les deux sens. 14 groupes bactériens étaient associés à une probabilité accrue d’insomnie, tandis que huit étaient liés à une probabilité réduite. De plus, l’insomnie était associée à une réduction de 43 à 79% dans sept groupes de bactéries et à une augmentation de 12 autres. Parmi ceux-ci, la bactérie Odoribacter s’est révélée particulièrement liée au risque d’insomnie.

« À partir de ces résultats, le microbiome intestinal commence à être considéré comme un biomarqueur et un futur objectif thérapeutique pour le traitement de l’insomnie », ont expliqué les experts. Selon Shangyun, une prochaine étape consisterait à évaluer des stratégies individualisées basées sur la microbiote pour améliorer le sommeil, allant des probiotiques et prébiotiques aux transplantations de microbiote fécal.

Pour la Dr. Ana Carolina Garrafa (MN 185.493), résidente en troisième année de gastro-entérologie à l’Hôpital de Clínicas et membre de l’équipe de transplantation de microbiote fécal, comprendre le lien entre la flore intestinale et le sommeil nécessite une observation des facteurs génétiques ainsi que des habitudes de vie.

L’insomnie n’affecte pas seulement l’humeur et la santé physique, elle peut également altérer l’équilibre bactérien. « Le microbiote intestinal peut influencer le sommeil grâce à la production de métabolites, la modulation du système immunitaire et l’interaction avec le système nerveux central. Ces mécanismes le relient à l’insomnie et à d’autres troubles mentaux », a souligné Garrafa. Parmi les bactéries protectrices, Faecalibacterium, qui produit du butyrate, un composé anti-inflammatoire, se distingue : « Les personnes souffrant d’insomnie ont généralement moins de Faecalibacterium, et cette absence favorise un environnement plus inflammatoire, ce qui est lié à une qualité de sommeil inférieure. »

Les habitudes alimentaires jouent un rôle fondamental dans l’équilibre bactérien. « L’alimentation influence directement la composition et l’activité du microbiote intestinal », a souligné Andruetto. Elle a ajouté : « Les aliments riches en fibres, fermentés ou contenant des bactéries vivantes favorisent la croissance des micro-organismes bénéfiques ».

Les probiotiques incluent des souches comme Lactobacillus et Bifidobacterium. Selon Garrafa, ces “peuvent moduler la microbiote, et selon des études expérimentales, améliorer la réponse au stress et la perception de la qualité du sommeil”. Les prébiotiques, quant à eux, sont des fibres qui nourrissent les bactéries protectrices —comme l’inuline de la chicorée, l’ail ou l’oignon— et stimulent la production de composés liés au sommeil.

Des expériences menées sur des modèles animaux ont démontré que certaines souches augmentent la diversité microbienne et modifient l’expression des récepteurs cérébraux de GABA, neurotransmetteur clé pour le sommeil. Bien que ces résultats attendent encore confirmation chez l’humain, « un régime alimentaire qui augmente la diversité microbienne pourrait contribuer indirectement à améliorer l’humeur et la qualité du sommeil », a souligné Andruetto.

De nombreux facteurs modifient la relation entre microbiome et insomnie. Les rythmes circadiens, organisant les cycles de sommeil et d’autres processus physiologiques, influencent l’activité bactérienne intestinale. Garrafa a averti : « Quand les horaires, la lumière ou les modèles alimentaires sont perturbés, tout ce système perd sa synchronisation, affectant la diversité microbienne et la production de composés essentiels pour un sommeil de qualité ». Le stress psychologique, le manque d’exercice, l’utilisation d’antibiotiques ou d’antiacides, ainsi que des maladies inflammatoires peuvent également altérer la flore bactérienne et, de manière indirecte, la qualité du sommeil.

Le lien entre humeur, stress et microbiote s’explique au niveau hormonal. « Lorsque une personne traverse une situation de stress, l’axe hypothalamus-hypophyse-surrénale est activé, ce qui augmente la libération de cortisol. Cela modifie la motilité intestinale, la sécrétion de mucus et la perméabilité de la barrière intestinale. En conséquence, il y a moins de bonnes bactéries et une augmentation des espèces pro-inflammatoires », a précisé Andruetto. Cette dysbiose favorise l’inflammation et affecte la production de neurotransmetteurs essentiels pour l’humeur et le sommeil. Ainsi, « une mauvaise qualité de sommeil aggrave la réponse au stress et le stress chronique nuit à la fois à la microbiote et à la qualité du sommeil », a résumé Garrafa.

Interrogée sur les actions que peuvent entreprendre les individus pour protéger l’équilibre bactérien, Garrafa a résumé : « L’alimentation joue un rôle fondamental dans la santé intestinale et la qualité du sommeil. Un régime riche en fibres —présent dans les fruits, légumes, légumineuses et céréales complètes— favorise le développement des bactéries bénéfiques, qui produisent des acides gras à chaîne courte : ces substances aident à réguler l’inflammation et participent à la production de neurotransmetteurs liés au sommeil”.

De plus, Andruetto a suggéré de rajouter des aliments fermentés tels que le yaourt, le kéfir, la choucroute, le kimchi ou le miso, qui sont associés à une diminution de l’anxiété et une amélioration de la qualité du sommeil.

Réduire les aliments ultra-transformés, les sucres raffinés, les boissons contenant de la caféine et l’alcool contribue à préserver la flore bactérienne et favorise un meilleur sommeil nocturne. Le mode de vie est également central : « Une activité physique régulière, maintenir des horaires réguliers de sommeil et créer un environnement propice au sommeil renforcent les rythmes circadiens », a noté Andruetto. Le contrôle du stress via des techniques telles que la méditation, la respiration consciente ou la thérapie cognitivo-comportementale peut également être bénéfique pour ceux souffrant d’insomnie, a complété Garrafa.

En Argentine, l’Hôpital de Clínicas de l’UBA met en place des stratégies novatrices pour restaurer l’équilibre bactérien chez les patients souffrant de pathologies digestives sévères. Le premier Banque de Microbiote du pays, actif dans cette institution, réalise des transplantations de microbiote fécal. « Ce traitement consiste à transférer le microbiote de donneurs sains à des patients pour lesquels les thérapies conventionnelles n’ont pas fonctionné. Nous avons observé des améliorations significatives dans la santé intestinale et l’évolution clinique des patients », a déclaré Garrafa. L’équipe de l’Hôpital de Clínicas participe à des réseaux interdisciplinaires et collabore à la formation continue sur des thérapies à la pointe.

L’avenir de la recherche vise à personnaliser de plus en plus les stratégies médicales, en intégrant l’analyse du microbiome comme biomarqueur diagnostique et thérapeutique.

Bien que le groupe chinois recommande de poursuivre des études avant d’incorporer des interventions ciblant l’intestin comme norme pour l’insomnie, les spécialistes s’accordent à dire que ces avancées offrent de nouvelles perspectives pour aborder l’insomnie de manière innovante et multidisciplinaire.